История индейского поселения Ранкагуа в статусе города начинается в 1743 году, когда последний вождь племени мапуче Tomás Guaglén оставил свои земли. В этом же году городской совет пожаловал небольшой участок недалеко от современной площади Plaza de los Héroes ордену мерседарианцев для постройки монастыря La Merced. Строительство продолжалось четыре года, и было завершено в 1754 году. Новый храм мерседарианцев получил название San Ramón Nonato, в честь главы монашеского ордена, кардинала, причисленного к лику святых. Несколько лет спустя его название изменили на церковь La Merced.
Здание церкви имело прямоугольную форму, и было выполнено из самана, что характерно для архитектуры XVIII-XIX веков. Единственная башня имела восьмиугольный фасад с изогнутым шпилем, а крыша была покрыта глиняной черепицей. Внутреннее убранство храма не имело никаких декоративных элементов, лишь гладкие белые стены. Все украшения были внесены в интерьер только в конце XIX века.
Самыми важными датами в истории католической церкви считаются первые числа октября 1814 года, когда генерал Bernardo O'Higgins был осажден испанским полковником Mariano Osorio и укрылся в церковной башне. Напрасно он ждал подкрепления, никто так и не пришел на помощь армии патриотов. Два дня отважно сражались его солдаты, но так и не смогли оказать решающее сопротивление. Наконец им удалось бежать в город Мендосу, хотя и не всем. Это событие стало поражением патриотического движения Чили и концом «Старой Родины».
За всю свою долгую историю здание церкви претерпело множество изменений, но самое разрушительное действие на нее оказало землетрясение 2010 года. Из-за многочисленных серьезных повреждений храм пришлось закрыть. Он пустовал в течение четырех лет, пока в 2014 году не начались восстановительные работы. Торжественное открытие церкви и выставочного зала, посвященного ордену мерседарианцев и битве за Ранкагуа, состоялось в 2016 году.